On entend de plus en plus parler du SIBO sur les réseaux et dans certains cabinets de santé. Derrière cet acronyme un peu barbare pourrait bien se cacher une cause sous-estimée de nombreux troubles digestifs — et même du syndrome de l’intestin irritable (SII).
Alors, qu’est-ce que le SIBO ? Quels symptômes peut-il provoquer ? Comment l’identifier et le distinguer d’un SII ? Je t’explique tout dans cet article.
Qu’est-ce que le SIBO ?
SIBO signifie Small Intestinal Bacterial Overgrowth, soit prolifération bactérienne de l’intestin grêle.
Normalement, notre microbiote intestinal est surtout concentré dans le côlon. L’intestin grêle, lui, contient très peu de bactéries. Mais, dans certaines conditions, ces micro-organismes deviennent trop nombreux et commencent à fermenter les résidus alimentaires. Résultat : production excessive de gaz, ballonnements, douleurs et troubles du transit.
Et ce n’est pas rare : on estime que 40 à 60 % des personnes souffrant d’un SII pourraient en réalité avoir un SIBO, souvent sans le savoir.
Les symptômes du SIBO
Le SIBO se manifeste par des signes proches du syndrome de l’intestin irritable :
- ballonnements après les repas,
- ventre qui gonfle au fil de la journée,
- gaz et crampes abdominales,
- diarrhée, constipation ou alternance des deux,
- nausées, reflux, éructations…
Mais ce n’est pas tout : le SIBO peut aussi se refléter sur la peau (rosacée, acné, eczéma), sur l’énergie (fatigue chronique, carences) ou encore sur le système immunitaire.
Les différents types de SIBO
On distingue aujourd’hui trois grandes formes de prolifération :
1. Le SIBO hydrogène (H₂)
C’est le plus fréquent. Il se manifeste souvent par des diarrhées, des gaz et un ventre qui gonfle très vite après les repas.
2. L’IMO (Intestinal Methanogen Overgrowth)
Anciennement appelé SIBO au méthane, il est lié aux archées méthanogènes. Il provoque surtout de la constipation, des éructations et des reflux.
3. Le SIBO hydrogène sulfureux (H₂S)
Souvent sous-diagnostiqué, il entraîne des gaz très odorants (odeur d’œuf pourri), des douleurs abdominales, des reflux, et peut donner aussi bien des diarrhées explosives que de la constipation sévère.
Conséquences possibles du SIBO
Le SIBO n’affecte pas seulement la digestion. Il peut entraîner :
- des carences nutritionnelles (fer, vitamine B12, vitamines A, D, E, K),
- une hyperperméabilité intestinale (“leaky gut”),
- une baisse d’enzymes digestives et de l’activité de la DAO (histamine),
- un ralentissement du CMM (complexe moteur migrant), la “chasse d’eau” naturelle de l’intestin grêle.
Ces déséquilibres expliquent pourquoi certaines personnes continuent à souffrir malgré une alimentation équilibrée ou une supplémentation.
Quelles sont les causes du SIBO ?
Le SIBO apparaît rarement par hasard. Parmi les causes fréquentes, on retrouve :
- une intoxication alimentaire,
- une hypothyroïdie ou un diabète,
- une hypochlorhydrie (manque d’acide gastrique),
- une chirurgie abdominale,
- des maladies digestives chroniques (Crohn, RCH),
- l’endométriose,
- certains médicaments (IPP, antibiotiques, opioïdes…),
- le stress chronique, qui ralentit la motilité digestive.
Pour l’IMO, la constipation joue souvent un rôle aggravant. Quant au SIBO H₂S, il est parfois favorisé par une alimentation ultra-transformée ou un régime FODMAP suivi trop longtemps sans réintroduction.
Comment diagnostiquer un SIBO ?
Le test respiratoire est aujourd’hui l’examen de référence. Il consiste à mesurer les gaz expirés après ingestion d’un sucre (glucose ou lactulose).
- Le test au glucose est le plus courant, mais il peut manquer certains cas (notamment l’IMO).
- Le test au lactulose est plus complet, surtout pour détecter un excès de méthane.
En France, certains laboratoires spécialisés proposent l’envoi de kits à domicile (ex. Alphabio via Ibiote). Compter environ 100 €, parfois partiellement remboursés avec une ordonnance médicale.
⚠️ Pour le moment, le SIBO hydrogène sulfureux (H₂S) n’est pas détectable via ce test en France, mais cela pourrait bientôt évoluer.
En résumé
- Le SIBO est une prolifération bactérienne de l’intestin grêle, souvent confondue avec le SII.
- Ses symptômes digestifs sont variés : ballonnements, gaz, diarrhée, constipation… mais il peut aussi provoquer des carences et des troubles extra-digestifs.
- Il existe 3 types principaux : hydrogène, méthane (IMO) et hydrogène sulfureux.
- Ses causes sont multiples et nécessitent un accompagnement personnalisé pour éviter les récidives.
- Le test respiratoire est l’outil de diagnostic le plus fiable aujourd’hui.
Si vous souffrez de troubles digestifs chroniques, il peut être pertinent d’investiguer du côté du SIBO. Un accompagnement adapté peut vraiment changer la donne et vous aider à retrouver un meilleur confort digestif.

